Como gerar mapas e aplicar metodos biogeograficos, Esquemas de Engenharia Florestal

Baixe Como gerar mapas e aplicar metodos biogeograficos e outras Esquemas em PDF para Engenharia Florestal, somente na Docsity! Como gerar mapas e aplicar métodos biogeográficos no Programa ArcView Gis 3.2a Elaine Della Giustina Soares (Doutorado) – Pós-graduação em Entomologia, Universidade Federal do Paraná _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ 1 Como gerar mapas e aplicar métodos biogeográficos no Programa ArcView Gis 3.2a Elaine Della Giustina Soares1 ______________________________________________________________________ Os mapas de distribuição podem ser utilizados para diversas finalidades, desde demonstrar a área de distribuição de uma espécie até servir como base para estudos em biogeografia histórica e conservação. Este tutorial visa facilitar a plotagem de distribuições de espécies em mapas no programa ArcView Gis 3.2a (ESRI, 1999). Os passos aqui demonstrados visam também facilitar a aplicação de métodos históricos em biogeografia: pan-biogeografia e análise de parcimônia de endemismo e o cruzamento de dados de distribuição com áreas previamente definidas como Ecorregiões. Além disto, aqui estão apresentados passos básicos para a utilização do programa Nexus Data Editor 0.5.0 para confecção de matriz de dados e do programa de análise de parcimônia NONA (Goloboff, 1993) interface WinClada version 0.9.9. 1 Plotando as localidades no mapa 1.1 Selecionar a planilha salva em .xls copiar e colar especial como valores em outra pasta, salvar esta pasta como DBF3 (dbase III).dbf . O programa Arcview só aceita tabelas salvas neste formato. 1.2 Além de estar salva como .dbf a tabela só deve conter valores com duas casas decimais e estas devem estar separadas por ponto, e não por vírgula (por exemplo: -55.67). 1.3 Ao abrir o Arcview a primeira janela pede a opção que se deseja, que deve ser “open as a blank project” 1.4 No cursor a esquerda deve-se selecionar a opção “tables”, isto permitirá que se adicione a tabela a ser trabalhada através do ícone “Add”, que abre a busca no diretório. 1.5 Após, abre-se a opção “View”. Nesta janela você irá adicionar os seus dados sobre o mapa. 1.6 Clicando em “View”, no cursor superior e, em Add Theme você pode buscar o mapa a ser adicionado. Este ícone vai aparecer no “frame” a esquerda. Marcando-se o ícone, o mapa aparecerá na área branca. 1.7 Clicando em “View” e, em Add Event Theme você pode buscar a tabela que você adicionou no item 1.4. Ainda na janela Add Event Theme deve-se buscar a longitude no campo X field e a latitude no Y field. 1 elainedgs@yahoo.com.br; pós-graduação em Entomologia UFPR Como gerar mapas e aplicar métodos biogeográficos no Programa ArcView Gis 3.2a Elaine Della Giustina Soares (Doutorado) – Pós-graduação em Entomologia, Universidade Federal do Paraná _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ 2 1.8 Seu ícone vai aparecer no “frame” a esquerda. Marcando-se o ícone, os pontos serão plotados sobre o mapa. 1.9 Visualizando as Espécies no mapa. Clicando duas vezes no ícone do táxon surgirá a janela “Legend Editor”. No campo “Legend Type” selecionar “Unique Value”, no campo “Values Field” aparecerão os títulos das colunas da sua tabela, selecionar espécie. Clicar “Apply”. Após a geração do mapa podemos, exportá-lo como arquivo de imagem ou aplicar os métodos da biogeografia histórica, propostos (PAE, pan-biogeografia e biogeografia cladística) sobre ele. 2 Exportando o mapa Para transformar o mapa em um arquivo de imagem (.bmp, .jpg...) é necessário exportar o mapa. 2.1 Em “View” encontramos a opção Layout, que permitirá a edição do mapa para exportação. Clicando em Layout surge a janela Template Manager onde pode-se escolher a orientação do mapa na página. Escolher e clicar ok. 2.2 Aparece a janela View-Layout, onde se escolhe o nome do Layout a ser criado, escolher a opção novo. 2.3 Surge o seu layout na tela. 2.4 Em “File” selecionar a opção “Extensions”, que abrirá uma janela onde deve-se selecionar as opções “ Add Gradicules and Measured Grids” e “JPGE (JFIF) Image Support” , tornando-as ativas. 2.5 Com a seta pode-se excluir os elementos supérfluos (rosa dos ventos, régua de escala...) 2.6 Selecionar o mapa com um clique 2.7 Em “File” selecionar a opção Export, que abrirá a janela de mesmo nome. 2.8 Selecionar a pasta onde o arquivo será salvo 2.9 Selecionar a opção Windows Bitmap, no campo “List Files Type:”, nomear o arquivo e salvar. 2.10Fechar a janela Layout Os mapas podem ser visualizados no programa Corel Photo Paint. 1 elainedgs@yahoo.com.br; pós-graduação em Entomologia UFPR Como gerar mapas e aplicar métodos biogeográficos no Programa ArcView Gis 3.2a Elaine Della Giustina Soares (Doutorado) – Pós-graduação em Entomologia, Universidade Federal do Paraná _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ 5 4.1.3.3 Em “Choose latitude and longitude intervals” podemos escolher a dimensão das quadrículas de nossa grade. Clicar Next 4.1.3.4 Clicar em Preview e Finish 4.2 Transformando o mapa de PAE em arquivo de imagem 4.2.1 Selecionar o mapa e a grade 4.2.2 Exportar o mapa como explicado nos itens 2.7-2.9 4.3 Criação da matriz de presença e ausência Após obtido o mapa, parte-se para a elaboração da matriz de presença e ausência. 4.3.1 As quadrículas onde existem espécies devem ser nomeadas. No PAE estas serão as unidades de estudo, portanto na matriz, as áreas devem corresponder às linhas (análogo à “Taxon”) e os táxons às colunas (análogo à Caráter- “Characters”) 4.3.2 Após, deve-se plotar na matriz quais espécies ocorrem em cada quadrícula. Atribui-se o valor zero a ausência da espécie na área e 1 a sua presença. 4.3.3 A matriz de presença e ausência será gerada no programa Nexus Data Editor 0.5.0. 4.3.3.1 Em “File”, selecionar “New”. 4.3.3.2 Em “Data”, nas opções “Add taxa” e “New Characters” pode-se adicionar o número de áreas (“Taxon”) e espécies (“Characters”) desejado. Deve-se adicionar um “Taxon” a mais, o primeiro da lista, com ausência de todas as espécies para o enraizamento da árvore (área hipotética). 4.3.3.3 Para adicionar os dados é só clicar sobre a matriz. Os movimentos para as outras casas pode ser feito com as setas do teclado. 4.3.3.4 Salvar no formato .nex 4.4 Construção do cladograma O cladograma será construído através do programa NONA (Goloboff, 1993) interface WinClada version 0.9.9, mas qualquer outro programa para análise filogenética pode ser utilizado. 4.4.1 Clicar em “File”, “Open file”, para abrir a matriz de dados gerada no NEXUS Data Editor 0.5.0. 1 elainedgs@yahoo.com.br; pós-graduação em Entomologia UFPR Como gerar mapas e aplicar métodos biogeográficos no Programa ArcView Gis 3.2a Elaine Della Giustina Soares (Doutorado) – Pós-graduação em Entomologia, Universidade Federal do Paraná _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ 6 4.4.2 No cursor superior selecionar “View”, “Numeric Mode”. Selecionar novamente em “View”, “Number all items from one (illogical style)”. Este passo deixará sua matrix com a configuração original. 4.4.3 No cursor superior selecionar “Analyze”, “Heuristics”, surgirá a janela “Nona search parameters” clicar no botão, aqui devem ser mudados os valores dos campos: “Maximum trees to keep” para 1000; “Number of replication” para 100; “Random seed” para um valor de 4 casas. Pode-se alterar o nome do campo “Name of stem for.out and .tre”, para o nome de sua matriz, suas árvores serão salvas com este nome na mesma pasta da sua planilha. Clicar em “Search”. 4.4.4 Aparecerá na tela o(s) cladograma(s) com a distribuição dos caracteres. 4.4.5 Selecionar em “Trees” a “Hard collapse unsupported nodes in ALL trees”. 4.4.6 No canto inferior direito está apresentado o número de cladogramas gerados. Para visualizar cada uma das árvores deve-se clicar “Trees”, opção “Next Tree”. Se houver mais de um cladograma o próximo passo é a geração do cladograma de consenso 4.4.7 Para obter o cladograma de consenso, clicar “Trees”, “Consensus- Compromise” opção “Consensus (strict)” 4.5 Salvando o cladograma como arquivo de imagem Clicando em “File” pode-se acessar a opção “Create Tree Metafile”. A árvore deve ser salva em .emf e pode ser visualizada no programa Corel Photo Paint. 5 Ecorregiões O programa ArcView permite a seleção, no mapa, das Ecorregiões de ocorrência do táxon. 5.1 Criar uma nova “view” 5.2 Acrescentar o mapa das Ecoregiões da América do Sul como explicado no item 1.6 5.2.1 Clicando 2 vezes sobre o ícone do mapa no frame a esquerda, aparecerá na tela a janela do “Legend Editor” 5.2.1.1 Selecionar no campo “Legend Type” a opção “Unique Value” 5.2.1.2 No campo “Value Field” selecionar “Ecoregion” 5.2.1.3 Clicar “Apply” 5.3 Adicionar os seus dados como indicado nos itens 1.7-1.9. 5.4 Selecionando as Ecorregiões de ocorrência dos táxons 5.4.1 Clicar no ícone das ecorregiões no “frame” da esquerda 1 elainedgs@yahoo.com.br; pós-graduação em Entomologia UFPR Como gerar mapas e aplicar métodos biogeográficos no Programa ArcView Gis 3.2a Elaine Della Giustina Soares (Doutorado) – Pós-graduação em Entomologia, Universidade Federal do Paraná _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ 7 5.4.2 no cursor superior selecionar “Theme” e em seguida “Select by Theme”, isto abrirá a janela de mesmo nome 5.4.2.1 no campo “Select features of active themes that” selecionar a opção “Intersect” 5.4.2.2 no campo “the selected features of” selecionar o nome da sua tabela 5.4.2.3 Clicar “Add to Set”, isto fará com que as Ecorregiões sobre as quais ocorrem o seu táxon sejam selecionadas 5.5 Salvando o mapa das Eco-regiões O mapa pode ser salvo como arquivo de imagem como explicado no item 2. 6 Áreas de Conservação O programa ArcView permite a seleção, no mapa, das Áreas de Conservação onde os táxons ocorrem. Para esta seleção basta proceder como no item 5. 7 Referências Craw, R.C., J.R. Grehan, and M.J. Heads. 1999. Panbiogeography: Tracking the history of life. Oxford. Biogeography Series n°11, 229 p. ESRI, 1999. ArcView®GIS 3.2a. Environmental Systems Research Institute, Inc. New York. Goloboff, P. 1993. NONA (NO NAME) ver. 2.0. Published by the author, Tucumán. Morrone, J.J. 1994b. On the identification of areas of endemism. Systematic Biology 43: 438-441. Nixon, K.C. 1999. Winclada (BETA) ver. 0.9.9. Published by the author, Ithaca. Platnick, N. 1991. On areas of endemism. Australian Systematic Botany 4. Sem número. Rosen, B.R. 1988. From fossils to earth history: Applied historical biogeography, pp. 437-481. In: Myers, A.A. and P.S. Giller (Edits.). Analytical biogeography: An integrated approach to the study of animal and plant distribution. Chapman & Hall. London. Elaborado por Elaine Della Giustina Soares, Programa de Pós-Graduação em Entomologia (Doutorado), Departamento de Zoologia, Universidade Federal do Paraná. Contato: elainedgs@yahoo.com.br. Ao utilizar ou divulgar este roteiro favor citar fonte e informar o autor sobre a utilização. Roteiro de aula prática para disciplinas ligadas à Biogeografia, desenvolvido dentro da Disciplina BZ 797- Pratica de Docência em Zoologia/Entomologia I do Programa de Pós-graduação em Ciências Biológicas (Entomologia) da Universidade Federal do Paraná. Já utilizado nas seguintes disciplinas, ministradas pelo professor Doutor Claudio José Barros de Carvalho: BZ775-Biogeografia (Curso de pós-graduação em Entomologia da UFPR, Curitiba-PR, 2002, 2003, 2004); BZ041- Conservação da Biodiversidade (Curso de graduação em Ciências Biológicas da UFPR, Curitiba-PR, 2002); Biogeografia Histórica e Métodos de Análise-BHA (Faculdade de Saúde Pública da Universidade de São Paulo, SP, 2003). 2 de Agosto de 2005. 1 elainedgs@yahoo.com.br; pós-graduação em Entomologia UFPR